攻壳机动队：崛起

2027年6月6日的一天，附属陆军隐秘戎行501机关的真室中佐在闹市陌头被人戕害，此前他曾陷入军械生意的行贿丑闻不得脱身，他对死亡背地自然隐蔽着无数谜团。阴雨之夜，试图取回真室电子脑的公安9课课长荒卷大辅与生化人草薙素子在真室中佐的墓地初次相遇。此时草薙还只是501机关担任收集非法追究的武士，此行她期望找到倍为恭敬的中佐蒙冤以及遇害背地的原形。谁知，棺木中的中佐早已不见了踪影。在此之后，她受到荒卷委托睁开查问拜访，并在一连串凶险追究的通过中与前特种戎行成员巴特和时为新滨县刑警的陀古萨邂逅。错综复杂的案情，草薙一行被引向未知的彼方。